Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCM1Q15154 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms