Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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