Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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