Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms