Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RAB40BQ12829 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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