Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TROQ12816 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
TROQ12816 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TROQ12816 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TROQ12816 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TROQ12816 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TROQ12816 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
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