Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
POLEQ07864 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms