Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms