Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms