Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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