Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms