Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A3P48751 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms