Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms