Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP8P40818 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP8P40818 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP8P40818 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP8P40818 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms