Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms