Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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