Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC3P19447 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms