Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LBPP18428 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LBPP18428 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms