Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms