Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms