Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGFRP00533 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGFRP00533 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGFRP00533 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGFRP00533 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGFRP00533 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGFRP00533 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGFRP00533 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGFRP00533 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGFRP00533 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGFRP00533 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGFRP00533 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGFRP00533 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGFRP00533 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGFRP00533 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGFRP00533 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGFRP00533 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms