Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL3O95573 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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