Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GABARAPO95166 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms