Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms