Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms