Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP3K13O43283 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms