Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC9O14530 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms