Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms