Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms