Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX8Q9Y5X2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms