Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL3Q9Y4R7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms