Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E1Q9Y466 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms