Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms