Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAB39Q9Y376 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAB39Q9Y376 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms