Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M1Q9Y2T2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms