Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
FAN1Q9Y2M0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAN1Q9Y2M0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms