Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BTRCQ9Y297 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BTRCQ9Y297 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms