Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM50BQ9Y247 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM50BQ9Y247 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms