Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG5Q9UPR3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG5Q9UPR3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms