Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX6Q9UPM6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX6Q9UPM6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms