Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4Q9UP95 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms