Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FZD1Q9UP38 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 370 ms