Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPCN1Q9ULQ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPCN1Q9ULQ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPCN1Q9ULQ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
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TPCN1Q9ULQ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TPCN1Q9ULQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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TPCN1Q9ULQ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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TPCN1Q9ULQ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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