Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms