Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDAC9Q9UKV0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms