Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1NQ9UHG2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCSK1NQ9UHG2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms