Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRP68Q9UHB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRP68Q9UHB9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRP68Q9UHB9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms