Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms