Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGXB4Q9UGU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms