Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPTCQ9UBM4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms