Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XCL2Q9UBD3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms